Due to the Corona virus education methods or examination can deviate. For the latest news please check the course page in Brightspace.

Prospectus

nl en

Integration: Biological Data Sharing and Integration

Course
2020-2021

Admission requrements

Not applicable.

Description

This course explores the use, reuse and reproducibility of data in biomedical science. As the amount and variety of biological data grows, we face new challenges in recording, publishing and sharing scientific results in a way that will allow further integration and exploitation. Consequently, data integration and reuse are central concerns in bioinformatics.

The course will cover 1) the principles and application of FAIR data (i.e. that data should be Findable, Accessible, Interoperable and Reusable), 2) the importance of provenance in data collection, analysis and aggregation, and 3) computational methods to improve reuse and reusability in science (including data standards, semantic annotation and scientific workflows).

Learning Objectives

  • Understand the principles of FAIR data and their growing importance across science

  • Obtain knowledge on the computational challenges and solutions for biological data sharing and integration.

  • Obtain (practical) knowledge on important tools for biological data processing, annotation and sharing

Timetable

The most recent timetable can be found on the student website:

Mode of Instruction

  • Lectures

  • Practical classes

  • Presentations

Assessment Method

  • Practical Assignments (70%)

  • Practical classes (10%)

  • Presentation (20%)

The teacher will inform the students how the inspection of and follow-up discussion of the exams will take place.

Literature

  • Scientific papers from conferences, workshops and journals.

Registration

Aanmelding voor vakken verloopt via uSis. Hiervoor is de uSis-code van het vak nodig, die te vinden zijn in de Studiegids. Meer info over het inschrijven voor vakken of tentamens is hier te vinden.

MyTimetable

In MyTimetable kun je alle vak- en opleidingsroosters vinden, waarmee jij je persoonlijke rooster kunt samenstellen. Onderwijsactiviteiten waarvoor je in uSis staat ingeschreven, worden automatisch in je rooster getoond. Daarnaast kun je My Timetable gemakkelijk koppelen aan een agenda-app op je telefoon en worden roosterwijzigingen automatisch in je agenda doorgevoerd; bovendien ontvang je desgewenst per e-mail een notificatie van de wijziging.

Vragen? Bekijk de video-instructie, lees de instructie of neem contact op met de ISSC helpdesk.

Brightspace

Inschrijving voor vakken verloopt via uSis. Wanneer je je hier inschrijft voor een bepaald vak krijg je automatisch ook toegang tot de omgeving van dit vak via Brightspace.

Voor meer informatie over Brightspace kun je op deze link klikken om de handleidingen van de universiteit te bekijken. Bij overige vragen of problemen kan contact opgenomen worden met de helpdesk van de universiteit Leiden.

Contact

Onderwijscoordinator Riet Derogee